Shkencëtarët rusë kanë sugjeruar një metodë të bazuar në kompjuter për të kërkuar substanca farmakologjike për t’u përdorur në trajtimin Covid-19. Kjo u diskutua në një takim në internet të organizuar nga Ministria e Shkencës dhe Arsimit të Lartë të Federatës Ruse, Akademisë Ruse të Shkencave dhe portalit Shkencor Rusia.
Kontradiktat e koronavirusit
Situata e koronavirusit po prek në mënyrë dramatike të gjitha aspektet e jetës njerëzore.
Më shumë se 19,000 vepra në SARS-CoV-2 / COVID-19 janë botuar gjatë pesë muajve të fundit.
“Fatkeqësisht, shumë nga këto botime kundërshtojnë njëra-tjetrën. Ndonjëherë është e vështirë të kuptosh se sa mirë justifikohen këto ose konkluzione të tjera”, tha Vladimir Poroykov, një anëtar korrespondent i Akademisë së Shkencave Ruse, kreu i Departamentit të Bioinformatikës së Institutit të Kimisë Biomjekësore Orekhovich.
Në të njëjtën kohë, ai beson se bota po dëshmon një shpejtësi të paparë të zbulimeve shkencore në fushën e luftimit të koronavirusit. Më 25 Janar, gjenomi i parë u deshifrua. Sot, ekzistojnë disa mijëra gjenome të deshifruara, dhe puna vazhdon ende.
Më 5 shkurt, u mor struktura e parë tre-dimensionale e enzimës, e cila bëri të mundur aplikimin e mëtutjeshëm të metodave molekuluese të modelimit për të kërkuar ilaçe korresponduese anti-COVID-19. Kuptimi i strukturës dhe ciklit të jetës së virusit na lejon të identifikojmë objektivat më premtues.
“Përkundër faktit se ne dimë gjithçka rreth COVID-19, ne nuk dimë asgjë në lidhje me të,” theksoi shkencëtari, duke shtuar se shumë aspekte të bashkëveprimit të virusit me trupin e njeriut janë ende një mister.
Për të dhënë një shembull, shkencëtari citoi një botim të kohëve të fundit në The Lancet (një nga revistat më të famshme mjekësore) duke thënë se përdorimi i hidroksilklorinës dhe klorokinës (ilaçet antimalariale që përdoren për trajtimin e COVID-19) nuk është e qëndrueshme.
Artikulli mblodhi një material të gjerë klinik. Megjithatë, disa ditë më vonë, tre nga autorët e artikullit tërhoqën emrat e tyre prej tij. “Ky shembull tregon se procesi po vazhdon dhe është jashtëzakonisht i diskutueshëm. Ne mund të vlerësojmë shumë çështje vetëm pas faktumit. Por ne nuk mund ta luftojmë virusin post factum, duhet ta luftojmë atë tani, “tha Vladimir Poroykov.
Kura “e re” është e vjetra e harruar prej kohësh
Për shkak të faktit se kërkon shumë kohë për të kërkuar dhe krijuar vaksina, shkencëtarët po përpiqen të ripozicionojnë ilaçet ekzistuese. Përpjekja e parë për ripozicionimin e një ilaçi (Dipyridamole, një agjent i mirënjohur antiplomatik) u bë përsëri në muajin mars kur një program kompjuterik tregoi se së bashku me efektin e tij antiplumbet, ilaçi pengon proteazën themelore të virusit.
Kjo u konfirmua in vitro, dhe shkencëtarët kinezë u transferuan menjëherë në fazën e testimit. Dy ekipe të mëdha kërkimore kryen një kontroll sistematik të ilaçeve. Njëra gjeti 13 komponime aktive, ndërsa një tjetër gjeti 64.
“Puna u krye në sisteme të ndryshme të testimit; asnjë prej ilaçeve të kryqëzuara me njëri-tjetrin. Dy punimet janë dy rezultate të ndryshme. Natyrisht, rezultatet e tilla kërkojnë sqarime, ”tha shkencëtari.
Instituti i Kimisë Biomjekësore Orekhovich bëri përpjekjen e tij për ripozicionimin e ilaçeve. Një nga ilaçet (Neratinib) u identifikua si një frenues i mundshëm i proteazës kryesore të virusit. Kjo tani duhet të provohet në mënyrë eksperimentale.
Parashikimi i kompjuterit
Kur shpërtheu pandemia, projekti Grand Challenge Against Covid-19 u lançua në Evropë. Organizatorët e projektit propozuan gjashtë objektiva; substancat duhet të gjenden për këto objektiva duke përdorur tre metoda të pavarura kompjuterike me më shumë se 1 miliard struktura të arritshme, përfshirë barnat e aprovuara për përdorim mjekësor.
Kryesuar nga Vladimir Poroykov, shkencëtarët rusë, të cilët kanë zhvilluar programe kompjuterike PASS për më shumë se 30 vjet dhe parashikojnë më shumë se 5000 lloje të veprimtarisë biologjike, kanë zgjedhur 4 objektiva: proteazën kryesore, proteazën papain, proteazën e varur nga ARN dhe proteazën e membranës njerëzore , e cila ndihmon që virusi të depërtojë në qelizë.
“Ne kemi përvojë në punën me Big Data: rreth një miliard komponime kimike të lidhura me një projekt në Institutin Kombëtar të Kancerit të SHBA. Për hulumtimin, ne përdorëm tre metoda: kërkimi i ngjashmërisë, mësimi i makinerisë dhe docking. Projekti i mëparshëm tregoi se komponimet aktive mund të gjenden me metoda të tilla, “tha shkencëtari. Në fazën e përgatitjes së mostrave të trajnimit, shkencëtarët duhej të bënin një analizë bioinformatike midis llojeve të ndryshme të virusit dhe të përfshijnë substanca nga llojet e tjera të viruseve në këto mostra trajnimi.
Gjatë hulumtimit, shkencëtarët rusë arritën në përfundimin se problemi i farmakoterapisë duhet të analizohet në mënyrë gjithëpërfshirëse – nga përgatitja e mostrave të trajnimit dhe trainimi i një sistemi të veçantë informatikë informatik deri në zgjedhjen e molekulave premtuese bazuar në parashikimin dhe testimin.
Sipas ekspertëve, për të marrë rezultate të besueshme kur kërkoni barna të reja, gjithçka duhet të jetë aq e koordinuar sa të jetë e mundur.
Aktualisht, janë përzgjedhur më shumë se 32 mijë molekula që mund të ndikojnë potencialisht në objektiv, është bërë një analizë makinerie dhe janë zgjedhur disa frenues të mundshëm, për të cilat modelimi molekular tregoi ndërveprim të mirë me proteazën kryesore të virusit.
“Në rastin e COVID-19, ne duhej të krijonim mostra trajnimi nga e para. Programi i parashikimit për ilaçet anti-koronavirus është pothuajse gati; ne do të japim rezultatet e para në muajin tjetër, “tha shkencëtari.
Burimi: sputniknews
Përshtati në shqip: Argumentum.al
© Argumentum
